Wat is het verschil tussen Microsatellite en Minisatellite

De grootste verschil tussen microsatelliet en minisatelliet is dat de repeterende eenheid van een microsatelliet bestaat uit 2-6 basenparen, terwijl de repeterende eenheid van een minisatelliet uit 10-100 basenparen bestaat. Verder bevat een array van microsatellieten 5-200 herhalingen, terwijl een array van minisatellieten 10 - 1.500 herhalingen bevat.

Microsatelliet en minisatelliet zijn twee soorten repetitief DNA in het genoom. Het belangrijkste gebruik van microsatelliet-DNA is voor DNA-vingerafdrukdoeleinden, terwijl dat van minisatellieten voor vaderschapstesten is, aangezien ze in familiegroepen voorkomen.

Key Areas Covered

1. Wat is Microsatellite
     - Definitie, structuur, belang
2. Wat is Minisatellite
     - Definitie, structuur, belang
3. Wat zijn de overeenkomsten tussen microsatelliet en minisatelliet
     - Overzicht van gemeenschappelijke functies
4. Wat is het verschil tussen Microsatellite en Minisatellite
     - Vergelijking van belangrijke verschillen

Sleutelbegrippen

DNA-vingerafdrukken, microsatelliet, minisatelliet, vaderschapstesten, repetitief DNA

Wat is Microsatellite

Een microsatelliet is een zich herhalende reeks van 2-6 basenparen in het genoom. Omdat het een type tandem-herhalingen is met korte sequenties van nucleotiden, zijn microsatellieten ook bekend als korte tandemherhalingen (STRs). De herhalingen van enkele nucleotiden worden single nucleotide polymorphism (SNP) genoemd. Bovendien komen microsatellieten door het hele genoom voor. In het menselijke genoom komen de dinucleotide-herhalingen voor in elke 30, 000 basenparen.

Figuur 1: vaderschapsanalyse

Bovendien zijn microsatellieten een zeer mutatief gebied in het genoom. De belangrijkste methode voor het verkrijgen van mutaties is door DNA-slippage tijdens replicatie. Unieke microsatellietsequenties komen voor in families. Daarom gebruiken we de analyse van microsatellieten voor vaderschapstesten. Bovendien veroorzaakt de verlenging van trinucleotide-microsatelliet-herhalingen ernstige menselijke aandoeningen zoals het Fragile X-syndroom en de ziekte van Huntington..

Wat is een Minisatelliet

Minisatellite is een repeterende sequentie van 10-100 baseparen in het genoom. Hier is de herhalende eenheid enigszins groot en wordt deze a genoemd DNA-motief. Een andere naam voor minisatelliet is variabele nummer tandem repeats (VNTR's). Het aantal VNTR's is zeer variabel tussen individuen. De repetitieve eenheid van een minisatelliet is GC-rijk.

Figuur 2: Minisatellieten

Vanwege het zeer variabele karakter van minisatellieten bij individuen, gebruiken wetenschappers ze voor DNA-vingerafdrukken. Ze gebruiken ook minisatellieten als genetische markers tijdens de koppelingsanalyse. Sommige minisatellietsequenties zijn betrokken bij de vorming van ras-oncogen-geassocieerde kanker.

Overeenkomsten tussen Microsatellite en Minisatellite

• Microsatelliet en minisatelliet zijn twee soorten zeer repetitief DNA bestaande uit tandemherhalingen in het eukaryotische genoom.
• Hoewel ze geen toegewezen functie in het genoom hebben, zijn ze belangrijk voor het behoud van de structuur van het genoom.
• Ook komen deze DNA-sequenties niet voor in de intergene gebieden. Daarom zijn ze niet-coderend DNA.
• Bovendien kunnen beide worden gebruikt bij de identificatie van individuen.
• Sommigen van hen kunnen worden geassocieerd met ziekten.
• Ze verschijnen als kleine, donkere banden in CsCl dichtheidsgradiëntanalyse.

Verschil tussen microsatelliet en minisatelliet

Definitie

Microsatelliet verwijst naar een reeks korte herhaalde DNA-sequenties op een specifieke locus op een chromosoom, die in aantal in verschillende individuen varieert en dus kan worden gebruikt voor genetische fingerprinting, terwijl minisatelliet verwijst naar een vorm van polymorf DNA, dat een variabel aantal tandemherhalingen omvat met repeterende eenheden van maximaal ongeveer 100 nucleotiden. Dit is het basisverschil tussen microsatelliet en minisatelliet.

Type Tandem Herhalingen

Microsatellieten zijn STR's, terwijl minisatellieten VNTR's zijn.

voorval

Bovendien komen microsatellieten voornamelijk in het hele genoom voor, terwijl minisatellieten voornamelijk aan de uiteinden van het genoom voorkomen.

Grootte van de herhalingseenheid

De grootte van de repeterende eenheid van een microsatelliet is 2-6 basenparen, terwijl de grootte van de repeterende eenheid van een minisatelliet 10-100 basenparen is. Dit is een groot verschil tussen microsatelliet en minisatelliet.

Aantal herhalingen per genoom

Een bepaalde herhalende eenheid komt ongeveer 5-200 keer voor in het genoom in microsatellieten, terwijl een bepaalde repeterende eenheid 10-1.500 keer voorkomt in minisatellieten.

Grootte van de array

Een ander verschil tussen microsatelliet en minisatelliet is dat de grootte van de reeks repeterende eenheden 10-1.000 basenparen in microsatellieten is, terwijl de grootte van de reeks repeterende eenheden 0,5 - 15 kb in microsatellieten is.. 

Complexiteit van Array

De array van microsatellieten is voornamelijk homogeen, terwijl de reeks minisatellieten heterogeen is.

Conclusie

Microsatelliet is een soort repetitief DNA in het eukaryote genoom met een 2-6 basenparen lange repetitieve sequenties. Ze zijn wijdverspreid door het hele genoom en kunnen worden gebruikt voor vaderschapstesten. Aan de andere kant is minisatelliet een type van repetitief DNA met 10-100 basenparen lange repetitieve sequenties. Ze komen vooral voor aan het einde van de chromosomen en kunnen worden gebruikt voor DNA-vingerafdrukken. Het belangrijkste verschil tussen microsatelliet en minisatelliet is dus hun structuur en belangrijkheid.

Referentie:

1. Ramel, C. "Mini- en microsatellieten." Milieugezondheidsperspectieven105 Suppl 4 (1997): 781-789. Beschikbaar Hier

Afbeelding met dank aan:

1. "Stadia van genvingerafdruk" door Sneptunebear16 - Eigen werk (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia  
2. "VNTRexample" By Madelyndotson - Eigen werk (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia